生理学报
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EEG等电生理数据开放共享合集

作者:Tom Donoghue

Hello,

这里是行上行下,我是喵君姐姐~

根据 Tom Donoghue等人整理的公开可用的电生理数据列表,进行了翻译和整理,数据类型主要有EEG,MEG,ECoG / iEEG和LFP等。此开放列表中所涉及的数据集可对用于科研的用户提供开放获取,部分数据最多只需要用户进行简单注册后即可申请获取资源。

因此,在使用数据前请务必仔细核查您访问的任何数据的许可证和/或使用协议。

此合集主要包括常用的数据存储云平台、EEG数据、MEG数据、人类颅内数据、动物的LFP数据等5个部分。

第一部分 常用的数据存储平台

此部分主要介绍用于核查和检索相关数据集的存储平台、期刊和搜索引擎等内容。

1.1 常用的数据存储平台

1. Zenodo

网址: eeg”,“ meg”或类似内容,然后选择搜索页面左下方的“ Dataset”标签来找到可用的数据集。

2.Open Science Framework(OSF)

网址: / MEG / ECoG数据集。

5.G-Node Open Data

网址: Open Data是G-Node(the German Neuroinformatics Node)在G-Node data infrastructure services 的基础上为科学数据集提供的存储服务。

6.Kaggle

网址: 神经科学专用数据存储平台

1.OpenNeuro

网址: Without Borders(NWB)

网址: Without Borders(NWB)是神经生理学的数据标准,旨在促进存储,共享和归档数据的通用标准。尽管不完全是通用存储库,但它们也确实维护了公开发布的NWB数据集列表( 开放数据发表期刊

主要介绍专门描述公开可用数据集和/或要求公开发布数据的期刊,包括:

Data

网址: Data可发表有关公开可用数据集的简短报告。此期刊的投稿经验可查阅:Sci. Data投稿经历 | 人类企鹅项目数据

2.Data in Brief

网址: in Brief可发表有关公开可用数据集的简短报告。

网址: EEG数据

此部分主要介绍公开可用的EEG数据或带有EEG数据的项目。

2.1 ChildMind Institute

网址: Institute是一家非营利性机构,参与发布大型数据集的大型研究项目。其项目主要有:

1 Project: Healthy Brain Networks

该项目包括一个约1000多成人的休息和任务脑电图数据。

主页: L. M., Escalera, J., Ai, L., Andreotti, C., Febre, K., Mangone, A., ... & Milham, M. P. (2017). An open resource for transdiagnostic research in pediatric mental health and learning disorders. Scientific data, 4(1), 1-26.

2 Project: Multimodal Resource for Studying Information Processing in the Developing Brain (MIPDB)

该项目包括6-44岁(n=126)年轻人群的静息和任务脑电图数据。

主页: N., Ho, E. J., Alexander, L. M., Xu, H. Y., Jozanovic, R. K., Henin, S., ... & Kelly, S. P. (2017). A resource for assessing information processing in the developing brain using EEG and eye tracking. Scientific data, 4(1), 1-20.

2.2 Physionet

Physionet 是生理数据的存档,并且在“neuroelectric”标签下包括一些EEG数据。

主页: A. L., Amaral, L. A., Glass, L., Hausdorff, J. M., Ivanov, P. C., Mark, R. G., ... & Stanley, H. E. (2000). PhysioBank, PhysioToolkit, and PhysioNet: components of a new research resource for complex physiologic signals. circulation, 101(23), e215-e220.

此外,公开可获取的EEG数据集有:EEG Motor Movement / Imagery (n=109): 等。

2.3 Patient Repository for EEG Data + Computational Tools (PREDICT)

PREDICT是EEG数据的存储库,专注于患者数据(在研究设置中收集)

主页: J. F., Napolitano, A., Wu, C., & Mueen, A. (2017). The patient repository for EEG data+ computational tools (PRED+ CT). Frontiers in neuroinformatics, 11, 67.

2.4 Temple University Hospital (TUH) Corpus